Un disque dur place les données au premier endroit libre qu'il trouve, les fichiers importants en données se trouvent souvent fragmentés en plusieurs endroits sur ce disque, d'où un surcroît de travail pour la tête de lecture du DD et un temps d'accès rallongé. La défragmentation consiste, via un logiciel utilitaire, à "recoller ensemble" les petits bouts de fichiers, de façon à optimiser leur emplacement et à obtenir un temps d'accès optimal.