Salut,
tes fichiers resteront présents sur le
disque dur mais ça ne veut pas dire que tes applications continueront à fonctionner, en effet il me semble que l'installation comme ceci en conservant le système de fichiers recrée tout windows à neuf quand même, donc la base de registres sera remise à neuf, avec tous les risques que ça peut comporter pour le bon fonctionnement des applications déjà présentes.
a +